Antitüberküloz triptantrin analoglarının elektronik ve topolojik özelliklerinin ve enoil-acp redüktaz ile etkileşimlerinin in siliko yöntemlerle incelenmesi

Amaç: Bu çalışmanın amacı, bir dizi triptantrin analogunun yapı- antitüberküloz aktivite ilişkilerini ve bu analogların Mycobacterium tuberculosis enoyl-acyl taşıyıcı protein (enoyl- ACP) redüktaz (InhA) ile bağlanma mekanizmalarını incelemektir. Yöntem: İlk olarak, elektronik-topolojik yöntem (ETM) ile bileşiklerin yapısındaki farmakofor ve anti-farmakoforlar tespit edilmiş ve ETM-Sinir Ağları (Neural Networks, NN) yaklaşımına dayalı olarak aktivite tahmin modelleri geliştirilmiştir. İkinci aşamada, moleküler kenetlenme yöntemi kullanılarak bileşiklerin InhA enzimine bağlanma afiniteleri ve konformasyonları elde edilmiş; bağlanmada etkili olan kovalent olmayan etkileşimler incelenmiştir. Son aşamada, bu etkileşimler sınır moleküler orbitallerin (FMO) elektron yoğunluğu dağılımı üzerinden tartışılmıştır. Bulgular: İnceleme altındaki bileşik serileri üzerine ETM-NN yönteminin uygulaması sonucunda Mycobacterium tuberculosis H37Rv suşuna karşı aktivite gösteren bileşiklerin karakteristik farmakofor ve anti-farmakofor özellik gösteren moleküler fragmanları tespit edilmiştir. Aktivite tahmin sistemine giren beş farmakofor (Phi) ve beş anti-farmakoforun (APhi) istatistiksel özellikleri sırasıyla 0,90 ve 0,86 olarak elde edilmiştir. Moleküler kenetlenme ve elektron yoğunluğu dağılımı analizleri, aktif bileşiklerin InhA enzimine daha kuvveti bağlandığını ortaya koymuştur. Sonuç: Tespit edilen farmakofor gruplar, kenetlenme sonuçları ve elektronik yapı hesaplamalarına dayalı olarak, Mycobacterium tuberculosis H37Rv'nin antitüberküloz aktivitesi için bir prognoz modeli geliştirilmiştir. Bu prognoz modeli, yeni potansiyel antitüberküloz ilaçların tasarımında kullanılabilecektir.